Digital Tlami Tank (TDT)

Artefarita inteligenteco plibonigas virusojn por genterapio

Dependovirusoj, aŭ parvovirusoj "asociitaj" kun adenovirusoj (AAV), estas tre utilaj iloj en Usono Gena terapio. Ĉi tio estas ĉar ili povas transdoni DNA en la ĉelon kaj estas sendanĝeraj por homoj. Tial ili estas uzataj kiel portantoj de la genetikaj informoj necesaj por batali malsanojn.

Bildfonto: Pixabay

Tamen ekzistas seriozaj limigoj, kiuj signifas, ke ilia uzo estas nuntempe severe limigita kaj ne ĉiuj pacientoj povas uzi ilin, tiel ke ne ĉiuj povas ricevi genan terapion. La unua el ĉi tiuj limoj estas la limigita kapablo de AAV, ligi al ĉeloj. La dua limigo estas la homa imunsistemo. Oni kalkulas, ke 50-70% de homoj kontraŭ unu AAV-infekto estas rezistemaj ĉar ili jam kontaktis iun formon de ĉi tiu viruso. En ilia kazo, genaj terapioj ne funkcias, ĉar la imunsistemo havas la tempon fari tion viruson detrui antaŭ ol ĝi eniros la ĉelon kaj kun ĝi la genetikan materialon necesan por efektivigi la terapion. Unu el la plej gravaj esploraj kampoj en genterapio estas do la provo imunsistemo superrugi.


D-ro. George Church de Harvard University laboris kun Google Research kaj Dyno Therapeutics unu Profunda lerna tekniko kutimis projekti tre malsamajn variantojn de la kapsido (proteina ŝelo) de la AAV-viruso. Esploristoj temigis la virusgenarsekvencojn kiuj kodigas por esenca proteinsegmento kiu ludas centran rolon en la infekto de celĉeloj kaj la rekono de la viruso de la imunsistemo spielt.


La specialistoj montris, ke per la uzo de artefarita inteligenteco eblas diferencigi grandan nombron da ili Kapsidoj tio tiam povas esti testita pri ilia kapablo eviti atakon de imunsistemo. La esploristoj komencis kun malgranda kvanto da datumoj pri unu Kapsidoceli 200.000 variantojn.


Nia esplorado klare montras, ke ni konas maŝinlernado grandega nombro da variantoj povas projekti, multe pli ol ekzistas en naturo. Ni daŭre rafinas nian teknologion por krei ne nur aviadilojn, kiuj povas elteni atakojn de la imunsistemo, sed ankaŭ por ligi al elektitaj histospecoj pli efike kaj selekte ", diris Eric Kelsic, doktoro, direktoro kaj kunfondinto de Dyno Therapeutics.
El artikolo publikigita en Nature, ni ekscias, ke prepara pritakso de la kapsidoj desegnita de la IA trovis, ke preskaŭ 60% povus funkcii. Ĉi tio estas signifa paŝo antaŭen. Hazarda mutagenezo nuntempe estas uzata por diferencigi kapsidojn, kun la procento de uzeblaj kapsidoj malpli ol 1%.
Ju pli ni devias de la natura aspekto de la AAV, des pli verŝajne la imunsistemo ne rekonos ĝin, aldonas Ph.D. Sam Sinai, la alia fondinto de Dyno Therapeutics, kiu gvidis la teamon, kiu administris la Komputila modelado plenumita. La ŝlosilo al sukceso tamen estas krei kapsidon, kiu povas stabile porti la DNA-utilan ŝarĝon. Konvenciaj metodoj akiri unu Kapsidoj estas tre tempopostulaj kaj rimed-intensaj, kaj tre malmultaj restas uzeblaj Kapsidoj ricevi. Ĉi tie ni tamen rapide povas trovi grandan varion AAV-kapsidoj gajni, kiu estas la bazo por la plua evoluo de Genaj terapioj estas disponeblaj por pli da homoj. "